Главният секретар се утвърждава от ИС по предложение на Председателя на НПСС. Към момента на избора си главният секретар трябва да е член на ОС с право на глас. Мандатът на Главният секретар започва от момента на утвърждаването му до приключване на мандата на органа, който го е утвърдил. Функциите на Главния секретар са: организира текущата дейност на НПСС между заседанията на ИС и ОС; предлага пред ИС за утвърждаване структура на секретариат; координира и ръководи дейността на секретариата; подпомага Председателя на НПСС по въпроси, свързани с административното и финансовото управление, както и с управлението на имуществото на НПСС; грижи се за информационната осигуреност и придава публичност на дейността на НПСС; периодично отчита дейността си пред Председателя на НПСС и ИС.